黑暗之潮故事线为：黑潮的剧情。
在暴风要塞被攻陷后，洛萨爵士重新集结了艾泽拉斯的残余部队，并带领着难民远渡重洋向北方的洛丹伦大批迁徙。人类七国领袖达成了共识：如果不阻止兽人部落，他们终将征服全人类，于是这七个国家团结起来组成了洛丹伦联盟。由阿拉索分裂出去的国家三千年来第一次团结在同一面旗帜之下。被指定为人类联盟最高指挥官的洛萨爵士为迎战即将大举进犯的兽人部落精心准备着他的部队。
在洛丹伦国王泰瑞纳斯帮助下，洛萨成功地使艾泽拉斯的各个非人类种族也意识到了迅速迫近的威胁。人类联盟成功地从铁炉堡铜须矮人、鹰巢山蛮锤矮人和一小部分奎尔萨拉斯的高等精灵那里获得了支持。由安纳斯特里亚·逐日者领导的精灵对即将发生的战争并没有多大兴趣，然而他们仍然为了履行由契约定下的义务而赶来支援洛萨爵士，因为洛萨是阿拉希最后的血脉，是那些曾在几个世纪前帮助过高等精灵的人类的唯一后代。
由奥格瑞姆·毁灭之锤领导的兽人部落从家乡德拉诺带来了食人魔，并招募了那些被夺走了家园的阿曼尼森林巨魔进入自己的部队。他们发动了规模空前的战役，席卷了由矮人统治的卡兹莫丹大陆和洛丹伦南方的区域，并毫不费力镇压了所有的反对力量。
第二次兽人战争从海上的零星冲突一直延伸到大规模的空中混战。不知是什么原因，龙喉氏族挖出了一个被称为恶魔之魂的强大神器，并用它奴役了红龙女王阿莱克斯塔萨。兽人部落以摧毁她珍贵的龙蛋为威胁，迫使阿莱克斯塔萨派遣她那些成年的孩子们参加战斗。高贵的红龙们不得不为兽人部落战斗。
战争遍及整个卡兹莫丹、洛丹伦等整个东部大陆。在北线的战役中，兽人部落将遥远的精灵王国奎尔萨拉斯的周边地区烧成了灰烬，这使得精灵们开始全力协助人类联盟作战。洛丹伦较大的市镇都被战事夷为平地，尽管缺乏援军并面临着兽人压倒性的优势，但是洛萨与他的同盟者还是成功遏制住了敌人前进的步伐。
然而，在第二次兽人战争的最后几天，当兽人部落对人类联盟的胜利近在咫尺的时候，艾泽拉斯的两个最强大的兽人之间爆发了一次可怕的分裂。当奥格瑞姆·毁灭之锤为进攻洛丹伦的首都——这将是一次可能粉碎掉人类联盟最后的残余力量的进攻——作最后的准备时，古尔丹和他的追随者擅离职守出海而去。兽人部落因为古尔丹的背叛而损失了将近一半驻军，暴怒的毁灭之锤不得不后撤，因此错过了战胜人类联盟的最佳机会。
极度渴望力量的古尔丹痴迷于获得神格，他拼命派出搜索队去寻找被埋葬在海底的萨格拉斯之墓，他相信在那里隐藏着终极力量的秘密。古尔丹已经将他的兽人同胞全部出卖给燃烧军团作为奴隶，他压根没有想过所谓对毁灭之锤尽职的问题。在暴掠氏族和暮锤氏族的支持下，古尔丹成功地在海底找到了萨格拉斯之墓。但是当他打开这远古地牢的大门时，古尔丹发现等待他的只有无数疯狂的恶魔。
为了惩罚那些临阵叛逃的兽人，毁灭之锤命令黑手氏族去追杀古尔丹并押回叛变的兽人。古尔丹为他的鲁莽付出了代价，他被自己释放的疯狂恶魔撕成了碎片。在他们的领导者死后，叛变的暴掠氏族以及暮光之锤氏族很快就被毁灭之锤愤怒的军团击溃。但在海上返航的黑手氏族却遭到了海军上将普罗德摩尔的库尔提拉斯海军的截击，虽然叛变被镇压了，但兽人部落已无法弥补这次内乱所带来的损失。古尔丹的背叛给联盟带来的不仅是希望，还有重新集结的时间以及发动反击的机会。图拉扬将军所部的联盟军队抓住了这次机会，将毁灭之锤的大军逐出了洛丹伦城下，兽人残部被迫南撤。
洛萨爵士看到兽人部落内部产生了分裂，就不失时机地集合了他最后的部队，帮助矮人击溃了围攻铁炉堡的基尔罗格的血窟氏族，毁灭之锤退守位于燃烧平原的最终要塞——黑石塔。在那里，人类联盟包围了兽人在黑石塔的据点，却被毁灭之锤出其不意地突袭。尽管洛萨爵士在塔底不幸战死，但他的副官图拉杨在最后时刻重新聚集起人类联盟的兄弟们，击溃了兽人最后的反抗力量，甚至俘虏了毁灭之锤本人。剩余的兽人部落被赶进了悲伤沼泽的深处。图拉扬的部队成功地毁灭了黑暗之门——那个连通兽人的家乡德拉诺和艾泽拉斯世界的神秘通道。被截断补给与后援的兽人部落终于在联盟的力量前崩溃了。
四分五裂的兽人氏族很快被赶进了戒备森严的俘虏收容所。虽然看起来兽人已经被完全击败了，但仍然有人怀疑这种和平能持续多久。此时已经赫赫有名的大法师卡德加说服联盟的高层建立了守望堡以监视黑暗之门的废墟，确保兽人不会再从德拉诺发动新的入侵。
