《针灸甲乙经》是古代汉医著作之一，为中国现存最早的一部针灸学专著。也是最早将针灸学理论与腧穴学相结合的一部著作。原名《黄帝三部针灸甲乙经》，简称《甲乙经》，晋皇甫谧（215-282年）编撰于魏甘露四年（259年），共10卷，南北朝时期改为12卷本。&;洞明医术，遂成其妙&;《针灸甲乙经》是中国针灸学专著，该书集《素问》、《针经》（即《灵枢》古名）与《明堂孔穴针灸治要》三书中之有关针灸学内容等分类合编而成。原书根据天干编次，内容主要论述医学之理论和针灸之方法技术，故命名为《针灸甲乙经》。皇甫谧本是一位史学家，年近50岁时，因患关节炎，加之耳聋，开始钻研针灸医术，学习上述三书，并将其中&;事类相从，删其浮辞，除其重复，论其精要&;而成书。人称其&;习览经方，手不辍卷，遂尽其妙&;，或誉之为&;晋朝高秀，洞明医术&;。可知其因病习医针灸而成功者。首先，《针灸甲乙经》在中国独具特色的针灸疗法的发展中，发挥了承先启后、继往开来的重大作用。众所周知，在此期间，中医学典籍《素问》、《灵枢》等虽有关于针灸学理论与技术的阐述，也有若干专门论述针灸经络的小册子，然而或已散落残佚，或只散见而不成系统，《针灸甲乙经》正是在这样的历史背景下对针灸经络、腧穴、主治等从理论到临床进行了比较全面系统的整理研究而成书的。
《针灸甲乙经》12卷，128篇。对人体生理、病理，经脉循行，腧穴总数、部位、取穴，针法、适应症、禁忌症等，都进行了系统的论述。书中论及人体生理、病理，基本是按照《黄帝内经》，但对针灸治疗学的特点，重新进行了编排。把与“用针”有密切关系的经文放在卷首，起开宗明义之效。
全书大致可分为两大部分。第一部分是基本理论、针灸基础知识；第二部分是针灸的临床运用。
理论部分包括前六卷，依次叙述人体的生理功能，包括五脏六腑、营卫气血、精神魂魄、精气津液及肢体五官与脏腑功能的关系等；其次是人体经脉、经筋等经络系统的循环路线；再次是人体腧穴，依身体部位分部叙述其位置、主治，书中共叙述腧穴350个（其中单穴51个，双穴299个）而不是如其所说的365穴，这些穴位是按头、面、项、胸、腹、臂、股等部位排列的，方便寻检，每一穴均有针刺的深度、灸灼的壮数；再次叙述诊法，重点介绍脉诊的内容，尤其是三部九候；其后介绍针道，针灸禁忌，包括禁穴；最后介绍了病理及生理方面的一些问题，并以阴阳五行学说为纲进行了一些阐释。
对于这些内容，皇甫谧都做了详细的考订。仅孔穴的位置考证上就纠正了不少前人的失误。如位于腹部正中线上的中脘穴（古时又称太仓穴），三国时东吴太医令吕广的《募腧经》说是在脐上三寸，而经皇甫谧考证是在脐上四寸处。因为中脘下一寸为建里，建里下一寸为下脘，下脘下一寸为水分，水分下一寸为脐，正好四寸。我们今天中医临床所采用的中脘穴定位，就是根据皇甫谧的说法来确定位置的
对于禁穴也有很深入慎重的研究。如“刺中心，一日死”、“刺中肺，三日死”、“刺中肝，五日死”、“刺中脾，十五日死”、“刺中肾，三日死”、“刺中胆，一日半死”、刺坏大血脉，“血出不止死”。
临床部分也是六卷，依次介绍内科（包括伤寒热病、中风、杂病）、五官科、妇科、儿科等病症的针灸治疗，其中内科共43篇，有外感六淫、内伤七情、五脏病、六腑病、经脉病及五官病等，外科有3篇，主要论述痈疽，至于妇科及儿科，各有1篇各论述20种及10种该科病症。
其中叙述病例0余症。这些病症除了根据《黄帝内经》外，还有进一步的充实和扩充。皇甫谧对这些病症的治疗方法、配穴规律、操作方法等均有详细的记载。
皇甫谧对具体操作是很重视的，对针灸的具体操作都做了非常详尽的解说。这种对临床的重视，与其研究的初衷是一致的。
